El estudio más grande de datos de secuenciación del genoma completo revela un ‘tesoro oculto’ de pistas sobre las causas del cáncer

El análisis de ADN de miles de tumores de pacientes del NHS ha encontrado un «tesoro oculto» de pistas sobre las causas del cáncer, con mutaciones genéticas que proporcionan una historia personal del daño y los procesos de reparación por los que ha pasado cada paciente.

En el estudio más grande de su tipo, un equipo de científicos dirigido por la profesora Serena Nik-Zainal de los Hospitales de la Universidad de Cambridge (CUH) y la Universidad de Cambridge, analizó la composición genética completa o las secuencias del genoma completo de más de 12,000 pacientes con cáncer del NHS. .

Debido a la gran cantidad de datos proporcionados por la secuenciación del genoma completo, los investigadores pudieron detectar patrones en el ADN del cáncer, o «firmas mutacionales», que brindan pistas sobre si un paciente ha estado expuesto en el pasado a causas ambientales del cáncer, como como el tabaquismo o la luz ultravioleta, o tiene fallas celulares internas.

El equipo también pudo detectar 58 nuevas firmas mutacionales, lo que sugiere que existen causas adicionales de cáncer que aún no comprendemos por completo.

Esta investigación fue apoyada por Cancer Research UK y se publicó hoy en la revista Ciencia. Los datos genómicos fueron proporcionados por el Proyecto 100.000 Genomas una iniciativa de investigación clínica en toda Inglaterra para secuenciar 100 000 genomas completos de alrededor de 85 000 pacientes afectados por enfermedades raras o cáncer.

La Dra. Andrea Degasperi, investigadora asociada de la Universidad de Cambridge y primera autora, dijo: «La secuenciación del genoma completo nos brinda una imagen total de todas las mutaciones que han contribuido al cáncer de cada persona. Con miles de mutaciones por cáncer, tenemos un poder sin precedentes para busque puntos en común y diferencias entre los pacientes del NHS, y al hacerlo descubrimos 58 nuevas firmas mutacionales y ampliamos nuestro conocimiento sobre el cáncer».

Serena Nik-Zainal, profesora de medicina genómica y bioinformática en la Universidad de Cambridge y consultora honoraria en genética clínica en CUH, dijo: «La razón por la que es importante identificar las firmas mutacionales es porque son como huellas dactilares en la escena del crimen: ayudar a identificar a los culpables del cáncer.Algunas firmas mutacionales tienen implicaciones clínicas o de tratamiento: pueden resaltar anomalías que pueden ser atacadas con medicamentos específicos o pueden indicar un posible «talón de Aquiles» en cánceres individuales.

«Pudimos realizar un análisis forense de más de 12 000 genomas de cáncer del NHS gracias a la generosa contribución de muestras de pacientes y médicos de toda Inglaterra. También creamos FitMS, una herramienta informática para ayudar a los científicos y médicos a identificar mutaciones antiguas y nuevas. firmas en pacientes con cáncer, para informar potencialmente el manejo del cáncer de manera más efectiva».

Michelle Mitchell, directora ejecutiva de Cancer Research UK, dijo: «Este estudio muestra cuán poderosas pueden ser las pruebas de secuenciación del genoma completo para dar pistas sobre cómo se pudo haber desarrollado el cáncer, cómo se comportará y qué opciones de tratamiento funcionarían mejor. Es fantástico esa información obtenida a través del NHS 100,000 Genomes Project se puede utilizar potencialmente dentro del NHS para mejorar el tratamiento y la atención de las personas con cáncer».

El profesor Matt Brown, director científico de Genomics England, dijo: «Las firmas mutacionales son un ejemplo del uso de todo el potencial de WGS. Esperamos usar las pistas mutacionales observadas en este estudio y aplicarlas nuevamente en nuestra población de pacientes, con el objetivo final de mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes con cáncer».