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Los trasplantes microbianos fecales muestran falta de previsibilidad cuando no se administra un tratamiento antibiótico previo al receptor

Los trasplantes microbianos fecales muestran falta de previsibilidad cuando no se administra un tratamiento antibiótico previo al receptor | Noticias de Buenaventura, Colombia y el Mundo

Un trasplante microbiano fecal, es decir, dar a un receptor materia fecal de un donante para cambiar la comunidad microbiana intestinal del receptor en el colon, ha sido una terapia de último recurso exitosa para las personas con infección recurrente por Clostridium difficile después de que varias rondas de antibióticos supresores hayan eliminado al receptor. comunidad microbiana.

Sin embargo, también se han realizado trasplantes microbianos fecales para alterar el metabolismo del receptor para reducir la obesidad o alterar la inmunidad para combatir el cáncer, y en esos trasplantes los receptores no reciben antibióticos supresores para eliminar la comunidad microbiana antes del trasplante. En estos casos, la comunidad intestinal inicial después del trasplante es un consorcio de microbios donantes y receptores que tienen que competir a medida que se introducen nuevas cepas microbianas en una comunidad establecida.

Investigadores de la Universidad de Alabama en Birmingham informan ahora en la revista Más uno que existe una falta de previsibilidad para que los trasplantes microbianos fecales cambien la comunidad microbiana intestinal para que se corresponda con la del donante cuando no hay un preacondicionamiento para reducir la comunidad microbiana del receptor. Esto contrasta con los trasplantes microbianos fecales de C. difficile después de la terapia antibiótica supresora, donde se observa una colonización estable a largo plazo de las cepas donantes hasta dos años después del trasplante.

«La traducción práctica de nuestro análisis sugiere el uso de tratamientos de trasplante microbiano prefecal para reducir las comunidades microbianas del receptor para facilitar una comunidad microbiana intestinal dominada por la cepa microbiana del donante después del trasplante microbiano fecal», dijo el investigador de la UAB Hyunmin Koo, Ph.D., y Casey Morrow, Ph.D. «Además, el muestreo longitudinal de pacientes individuales con trasplante microbiano fecal en combinación con el análisis de seguimiento de cepas para monitorear el estado de la comunidad microbiana posterior al trasplante microbiano también sería importante para evaluar la estabilidad y, en última instancia, el éxito del trasplante microbiano fecal. .»

Koo y Morrow analizaron la secuenciación metagenómica publicada por Davar et al. en Science en 2021, utilizando dos métodos establecidos de seguimiento de cepas, el método de seguimiento de cepas WSS desarrollado en la UAB y la herramienta de genómica de población a nivel de cepa StrainPhlAn. WSS puede detectar si una cepa donante o receptora de una especie particular de microbios intestinales es dominante después de los trasplantes microbianos fecales, y StrainPhlAn proporciona un árbol filogenético de microbios relacionados con el donante o microbios relacionados con el receptor.

El grupo de Davar entregó trasplantes microbianos fecales de pacientes que respondieron a la inmunoterapia anti-PD-1 para el melanoma a pacientes receptores que eran resistentes a la inmunoterapia, ya que se había visto que la composición de la microbiota intestinal se correlaciona con la eficacia de los anti-PD-1. 1 terapia en modelos animales y pacientes con cáncer. Seis de 15 pacientes se beneficiaron.

Koo y Morrow analizaron cinco trasplantes microbianos fecales realizados por el grupo Davar en los que se tomaron muestras de la microflora del receptor varias veces durante 535 días después del trasplante microbiano fecal. Estos datos metagenómicos publicados permitieron un análisis de seguimiento de cepas de series temporales.

Los investigadores de la UAB encontraron que tres especies bacterianas de Alistipes y una especie de Parabacteroides tenían patrones, post-trasplante microbiano fecal, de cepas dominantes del donante o del receptor dominante en las heces.

Por el contrario, Bacteroides uniformis y Bacteroides vulgatus mostraron una oscilación interindividual a lo largo del tiempo con la apariencia de dominancia de la cepa fecal del donante o del receptor. Para aumentar aún más la complejidad, hubo algunos casos de cepas dominantes de las dos especies de Bacteroides que no estaban relacionadas ni con la cepa donante ni con la receptora. Además, una cepa de Bacteroides vulgatus mostró un posible evento de recombinación genética entre las cepas donante y receptora.

«Los complejos patrones oscilantes de la aparición del donante dominante fecal, el receptor o las cepas no relacionadas después de un trasplante microbiano fecal de tiempo prolongado proporcionan nuevos conocimientos sobre la dinámica de las interacciones de la comunidad microbiana con los receptores después del trasplante microbiano fecal», dijo Morrow. «El resultado de nuestro análisis tiene implicaciones para el uso del trasplante microbiano fecal para cambiar de manera predecible las funciones biológicas de la comunidad intestinal en el metabolismo y la inmunidad del huésped».

Morrow es profesor emérito del Departamento de Biología Celular, del Desarrollo e Integrativa de la UAB, y Koo es bioinformático del Departamento de Genética de la UAB. Ambos departamentos se encuentran en la Escuela de Medicina Marnix E. Heersink.

Fuente de la historia:

Materiales proporcionado por Universidad de Alabama en Birmingham. Original escrito por Jeff Hansen. Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.

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