Investigadores del microbioma desafían los últimos avances en el descubrimiento de biomarcadores del cáncer de colon

Por primera vez, investigadores de VIB-KU Leuven, UZ Leuven, Janssen Pharmaceutica y múltiples colaboradores internacionales han introducido métodos cuantitativos y un amplio control de factores de confusión para descubrir biomarcadores de microbiomas en el desarrollo del cáncer colorrectal. Si bien en el pasado se han propuesto múltiples taxones microbianos como posibles biomarcadores asociados al cáncer, este nuevo estudio descubre contribuciones ocultas que pueden haber dado lugar a asociaciones incorrectas. Los resultados han sido publicados en Medicina de la naturaleza.

La investigación del microbioma del cáncer ha dado pasos significativos durante la última década, lo que ha llevado a nuevos conocimientos sobre los biomarcadores asociados al cáncer. A pesar de los numerosos avances científicos, las investigaciones anteriores se han centrado en métodos descriptivos y no cuantitativos de descubrimiento de biomarcadores. Una investigación dirigida por el Centro de Microbiología VIB-KU Leuven, UZ Leuven y Janssen Pharmaceutica muestra ahora los riesgos de seguir estos métodos. En su última publicación, tienen en cuenta los factores de confusión del microbioma y la cuantificación absoluta, con resultados sorprendentes.

Para este estudio pionero, los investigadores combinaron el perfil cuantitativo del microbioma (QMP) con un extenso fenotipado de pacientes de un grupo de 589 pacientes en diversas etapas de cáncer colorrectal. Además, volvieron a analizar los datos de quince estudios publicados que abarcan un total de 4.439 pacientes y controles.

El estudio reveló que, en ausencia de control de los factores de confusión, los resultados son equivalentes a los declarados por los autores de las cohortes publicadas. Sin embargo, cuando se incorporan el control de factores de confusión y métodos cuantitativos absolutos, se revela que algunas asociaciones de biomarcadores microbianos previamente afirmadas están impulsadas por otros factores en lugar del diagnóstico de cáncer.

«Este estudio muestra que debemos separar el trigo de la paja cuando estudiamos biomarcadores asociados al cáncer. Al implementar el control de factores de confusión y la elaboración de perfiles cuantitativos, pudimos revelar posibles asociaciones engañosas entre los marcadores microbianos y el desarrollo del cáncer colorrectal, por ejemplo, impulsado por la inflamación intestinal. «, dice el profesor Dr. Jeroen Raes, IP y vicedirector del Centro de Microbiología VIB-KU Leuven y del Instituto Rega de la Facultad de Medicina de KU Leuven.

El estudio identifica el tiempo de tránsito, la calprotectina fecal y el IMC como covariables microbianas primarias, superando la varianza explicada por los grupos de diagnóstico tradicionales de CCR. Sorprendentemente, los objetivos de CCR de microbioma bien establecidos, como Fusobacterium nucleatum, no logran asociarse significativamente con los grupos de diagnóstico de CCR cuando se controlan estas covariables.

En cambio, el estudio subraya las sólidas asociaciones de Anaerococcus vaginalis, Dialister pneumosintes, Parvimonas micra, Peptostreptococcus anaerobius, Porphyromonas asaccharolytica y Prevotella intermedia con el CCR, destacando su potencial como futuros objetivos de intervención.

«Esta investigación subraya la importancia de metodologías rigurosas para desentrañar asociaciones complejas entre enfermedades y microbiomas. Muchos de los objetivos descubiertos han sido en su mayoría ignorados hasta ahora», comenta Raul Yhossef Tito-Tadeo, primer autor y postdoctorado en el Raes Lab.

Sara Verbandt, directora de investigación del Grupo de Oncología Digestiva de KU Leuven, añade: «Nuestros resultados muestran la importancia de un fenotipado riguroso de los pacientes. Recopilar todos estos datos adicionales en un estudio supone una enorme cantidad de trabajo, pero vale la pena el esfuerzo».

Las implicaciones clínicas de este estudio son importantes. Existe una gran necesidad de diagnósticos rápidos y no invasivos del cáncer de colon. Las herramientas de detección actuales (por ejemplo, basadas en la presencia de sangre en las heces) no son lo suficientemente específicas y requieren demasiadas colonoscopias innecesarias, lo que supone una carga innecesaria para el sistema de atención sanitaria.

«Las pruebas de heces rápidas y específicas permitirán realizar pruebas tempranas a un número mucho mayor de personas, evitando muchas muertes innecesarias por cáncer de colon», concluye la profesora Dra. Sabine Tejpar, gastroenteróloga de la UZ Leuven, jefa del grupo de Oncología Digestiva y profesora de la Facultad de Medicina KU Leuven.